MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327782
2	NC_015727	GCC	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
3	NC_015727	GCC	2	6	341	346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
4	NC_015727	GGA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
5	NC_015727	CGC	2	6	423	428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
6	NC_015727	GA	3	6	442	447	50 %	0 %	50 %	0 %	339327782
7	NC_015727	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327782
8	NC_015727	TG	3	6	594	599	0 %	50 %	50 %	0 %	339327782
9	NC_015727	CTTGA	2	10	713	722	20 %	40 %	20 %	20 %	339327782
10	NC_015727	CTTG	2	8	898	905	0 %	50 %	25 %	25 %	339327782
11	NC_015727	TCA	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
12	NC_015727	TCA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
13	NC_015727	GTT	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327782
14	NC_015727	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327782
15	NC_015727	CGTG	2	8	1090	1097	0 %	25 %	50 %	25 %	339327782
16	NC_015727	TCGA	2	8	1133	1140	25 %	25 %	25 %	25 %	339327782
17	NC_015727	TGA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327782
18	NC_015727	CA	3	6	1207	1212	50 %	0 %	0 %	50 %	339327782
19	NC_015727	GGT	2	6	1266	1271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327782
20	NC_015727	GGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
21	NC_015727	GC	3	6	1302	1307	0 %	0 %	50 %	50 %	339327782
22	NC_015727	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
23	NC_015727	CGG	2	6	1343	1348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327783
24	NC_015727	GCGTC	2	10	1475	1484	0 %	20 %	40 %	40 %	339327783
25	NC_015727	CGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327783
26	NC_015727	GC	3	6	1656	1661	0 %	0 %	50 %	50 %	339327783
27	NC_015727	CGT	3	9	1695	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
28	NC_015727	GAC	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327783
29	NC_015727	CTGT	2	8	1786	1793	0 %	50 %	25 %	25 %	339327783
30	NC_015727	TGC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
31	NC_015727	GC	3	6	2088	2093	0 %	0 %	50 %	50 %	339327783
32	NC_015727	T	7	7	2134	2140	0 %	100 %	0 %	0 %	339327783
33	NC_015727	CAC	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327783
34	NC_015727	AAGT	2	8	2275	2282	50 %	25 %	25 %	0 %	339327783
35	NC_015727	T	8	8	2318	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015727	CG	3	6	2348	2353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015727	CGCA	2	8	2460	2467	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
38	NC_015727	CGCA	2	8	2617	2624	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
39	NC_015727	TCG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327784
40	NC_015727	GC	3	6	2931	2936	0 %	0 %	50 %	50 %	339327784
41	NC_015727	C	6	6	3122	3127	0 %	0 %	0 %	100 %	339327784
42	NC_015727	C	6	6	3353	3358	0 %	0 %	0 %	100 %	339327784
43	NC_015727	C	6	6	3935	3940	0 %	0 %	0 %	100 %	339327784
44	NC_015727	GC	4	8	3982	3989	0 %	0 %	50 %	50 %	339327784
45	NC_015727	GCT	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015727	ACC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015727	GCT	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015727	CCG	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015727	CGGC	2	8	4311	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015727	TTC	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015727	CA	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015727	GA	3	6	4504	4509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015727	TGGC	2	8	4519	4526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015727	CCG	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
55	NC_015727	GC	3	6	4637	4642	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
56	NC_015727	GCC	2	6	4730	4735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
57	NC_015727	TCC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327785
58	NC_015727	CGGC	2	8	4825	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
59	NC_015727	CGG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
60	NC_015727	GGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
61	NC_015727	CCA	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327785
62	NC_015727	C	6	6	5012	5017	0 %	0 %	0 %	100 %	339327785
63	NC_015727	GC	3	6	5108	5113	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
64	NC_015727	CAG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327785
65	NC_015727	CG	3	6	5151	5156	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
66	NC_015727	CCAG	2	8	5325	5332	25 %	0 %	25 %	50 %	339327785
67	NC_015727	GCGG	2	8	5450	5457	0 %	0 %	75 %	25 %	339327785
68	NC_015727	AAG	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327785
69	NC_015727	GGCC	2	8	5513	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
70	NC_015727	GCGCC	2	10	5545	5554	0 %	0 %	40 %	60 %	339327785
71	NC_015727	ACTG	2	8	5565	5572	25 %	25 %	25 %	25 %	339327785
72	NC_015727	GC	3	6	5582	5587	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
73	NC_015727	CGG	2	6	5601	5606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
74	NC_015727	GC	3	6	5624	5629	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
75	NC_015727	GCCC	2	8	5649	5656	0 %	0 %	25 %	75 %	339327785
76	NC_015727	GGC	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015727	ATT	2	6	5849	5854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339327786
78	NC_015727	TCCG	2	8	5877	5884	0 %	25 %	25 %	50 %	339327786
79	NC_015727	CAGGCC	2	12	5896	5907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339327786
80	NC_015727	TCG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327786
81	NC_015727	GAAG	2	8	5922	5929	50 %	0 %	50 %	0 %	339327786
82	NC_015727	ACC	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327786
83	NC_015727	CGC	2	6	6033	6038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327786
84	NC_015727	TGC	2	6	6048	6053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015727	GCC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015727	GCGGCT	2	12	6077	6088	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015727	ACGG	2	8	6101	6108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015727	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015727	ATT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015727	CCGC	2	8	6253	6260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_015727	C	7	7	6271	6277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_015727	GCCA	2	8	6302	6309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015727	GGCG	2	8	6428	6435	0 %	0 %	75 %	25 %	339327787
94	NC_015727	TGCGC	2	10	6445	6454	0 %	20 %	40 %	40 %	339327787
95	NC_015727	CG	3	6	6536	6541	0 %	0 %	50 %	50 %	339327787
96	NC_015727	AGC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327787
97	NC_015727	GCTC	2	8	6629	6636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015727	GGC	2	6	6733	6738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015727	CAT	2	6	6740	6745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015727	CG	3	6	6887	6892	0 %	0 %	50 %	50 %	339327788
101	NC_015727	CAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327788
102	NC_015727	CCT	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327788
103	NC_015727	GC	3	6	7017	7022	0 %	0 %	50 %	50 %	339327788
104	NC_015727	CCTG	2	8	7040	7047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015727	GC	3	6	7061	7066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015727	AAC	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015727	GCGCG	2	10	7079	7088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015727	GTT	3	9	7126	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327789
109	NC_015727	CAG	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
110	NC_015727	TCA	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327789
111	NC_015727	CAG	2	6	7249	7254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
112	NC_015727	TGG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327789
113	NC_015727	GGCG	2	8	7309	7316	0 %	0 %	75 %	25 %	339327789
114	NC_015727	GCC	2	6	7375	7380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327790
115	NC_015727	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
116	NC_015727	CAA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
117	NC_015727	CACTTG	2	12	7431	7442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339327790
118	NC_015727	CTG	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015727	AGC	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015727	CGCTC	2	10	7600	7609	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_015727	GCC	2	6	7676	7681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
122	NC_015727	CGA	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
123	NC_015727	GGC	2	6	7771	7776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
124	NC_015727	GCG	2	6	7787	7792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
125	NC_015727	GGGCA	2	10	7808	7817	20 %	0 %	60 %	20 %	339327791
126	NC_015727	GT	3	6	7840	7845	0 %	50 %	50 %	0 %	339327791
127	NC_015727	GA	3	6	7858	7863	50 %	0 %	50 %	0 %	339327791
128	NC_015727	GATGCG	2	12	7871	7882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339327791
129	NC_015727	CGAG	2	8	7903	7910	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
130	NC_015727	GCC	2	6	7928	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
131	NC_015727	CGA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
132	NC_015727	GC	4	8	8017	8024	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
133	NC_015727	GC	3	6	8061	8066	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
134	NC_015727	GC	3	6	8093	8098	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
135	NC_015727	CCA	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327791
136	NC_015727	GCA	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
137	NC_015727	GCC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
138	NC_015727	GCAG	2	8	8163	8170	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
139	NC_015727	GGCC	2	8	8203	8210	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
140	NC_015727	CGC	3	9	8267	8275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
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142	NC_015727	CCGG	2	8	8317	8324	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
143	NC_015727	CGC	2	6	8371	8376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
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149	NC_015727	CCGG	2	8	8601	8608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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247	NC_015727	ACA	2	6	13016	13021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_015727	TCGA	2	8	13082	13089	25 %	25 %	25 %	25 %	339327796
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252	NC_015727	CAC	2	6	13262	13267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327796
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258	NC_015727	GGCG	2	8	13400	13407	0 %	0 %	75 %	25 %	339327796
259	NC_015727	GCC	2	6	13422	13427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327796
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263	NC_015727	CGA	2	6	13620	13625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327796
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267	NC_015727	TCG	2	6	13857	13862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327797
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